【求助】请帮我看一下我的双向电泳问题在哪
2009-05-16 09:19:32 AM
我刚刚开始涉足双向电泳,目前做的是污染物的生物降解,想要分析细菌在污染物诱导下与无诱导下的蛋白差异。是IEF胶,最初用的两性电解质是3-10(BIORAD的),但一向胶凝得并不好,胶缩大概有1-2cm。而且很奇怪的,跑出来的双向胶蛋白都集中在酸性端。因为怀疑是两性电解质的问题,我又借用了别的实验室的安玛西亚的两性电解质,是5-8的,一向胶凝得挺好的,跑的双向电泳图会好些,但是还是比较集中在酸性端。不知道问题在哪,恳请大家帮我分析一下,不胜感激啊!
(缩略图,点击图片链接看原图)
上面是两性电解质为3-10跑出来的电泳图,下面是5-8的。
(缩略图,点击图片链接看原图)
可能在蛋白的提取制备过程中存在问题,因为中性和碱性蛋白如此少,一般似乎不太可能。
但从5-8和3-10的结果来看,蛋白点跑的还是挺好的,特别是5-8的胶。因此也许你的蛋白质可能绝大部分为酸性蛋白。可继续选用4-6或5-6的胶条做做看。
建议查一下文献,看看你所做的菌株在文献中是否有相似结果。
典型的盐多
谢谢DIGE,我查了一下,和我这株菌同属的用的基本上是4-7的,因此我下一步准备试试看这个范围的两性电解质效果如何,谢谢你了!
2Der,能具体说说吗,这个样品的制备是直接加裂解液超声的,确实有可能是盐的关系,不过具体我不太懂。但是我之前有的样品用丙酮沉淀的,跑出来的效果和上面的差不多。谢谢你!
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